Loading...Група вірусологів з Колумбійського університету (Нью-Йорк) представила унікальні інструменти для виявлення вірусів присутніх в організмі ссавців, у тому числі і людини. Техніка дозволяє визначити інфекційний агент серед тисяч відомих видів. Причому фахівцеві навіть не потрібно вводити додаткові дані і гіпотези.
Один з авторів роботи Іен Липкин (Ian Lipkin) підкреслює, що новий винахід, якому дали назву VirCapSeq-VERT, стане проривом у сфері вірусології та діагностики. Як доказ він наводить складний випадок, що зустрівся в його практиці. На прийом до Липкиной прийшов молодий чоловік, який скаржився на жахливий стан здоров'я після пересадки кісткового мозку. Проведені обстеження не давали точних даних про причину захворювання, констатуючи лише факт сильного запалення судин.
Вченому вже одного разу довелося зіткнутися з подібним випадком, коли причиною виникнення хвороби став невідомий раніше поліомавірус. У випадку з молодою людиною йому також здавалося, що мова піде про якойсь новий збудник. Однак обробка аналізів за допомогою нової системи показала, що чоловік заразився вірусом денге. Дана інформація побічно підтверджувалася недавнім відвідуванням пацієнтом В'єтнаму, де вірус поширений досить широко.
Також Липкин підкреслив, що під час обстеження, медики навіть не збиралися шукати вірус денге в крові молодої людини. Справа в тому, що сучасні клінічні дослідження будуються на гіпотезах. Приміром, лікарі припустили, що чоловік хворий ентеровірусом. Після отримання негативних аналізів, пацієнта перевіряють на зараження вірусом герпесу. Виробляти вибіркові аналізи таким чином можна до безкінечності, адже на сьогоднішній день науці відомі тисячі інфекційних агентів.
Система VirCapSeq-VERT, навпаки, дозволяє провести максимально широке дослідження. Вже сьогодні тестові зразки обладнання здатні перевірити людину на всі відомі інфекційні збудники. Винахід Нью-Йоркських вчених об'єднує в собі переваги ПРЦ, яка здатна відокремити гени носія від генетичного матеріалу збудника, проте вимагає наявність виразної гіпотези, і методу секвенування ДНК, здатного визначити вірус за наявними генам, але може похвалитися граничною чутливістю до генетичного матеріалу носія. Суть методу полягає у визначенні всіх підозрілих генів, які потім фільтруються за допомогою секвенування. У підсумку система залишає тільки сліди присутніх в крові вірусів.
На сьогоднішній день устаткування протестували на виявлення збудників грипу, денге, Ебола і MERS. Для проведення тестів використовували не тільки кров тварин і людини, а й інші біологічні рідини. У всіх випадках точність визначення присутніх в організмі вірусів була на висоті.
Вчені відзначають, що ймовірність видачі хибнопозитивних результатів вкрай мала, зважаючи на отримання повних геномів інфекційних агентів. Також система дозволяє відстежити мутовані віруси, які часто не піддаються стандартним методам діагностики. Потенційно VirCapSeq-VERT здатний визначити нові збудники, які мають 60% схожість з відомими штамами.
За прогнозами авторів проекту, VirCapSeq-VERT потребує більш серйозному тестуванні. Проте вже сьогодні можна сказати, що інноваційна система буде затребувана в медичній практиці, адже крім високої ефективності вона може аналізувати дані більше двох десятків зразків одночасно, що істотно знижує витрати на проведення медичних досліджень.
No comments yet.