Що таке секвенування, в чому полягає цей метод визначення захворювання і чим він відрізняється від вже відомих.
Про розробки в сфері молекулярної діагностики кореспонденту VitaPortal.ru розповів керівник відділу молекулярної діагностики та епідеміології ФГУН ЦНІІЕ Росспоживнагляду, кандидат медичних наук Герман Шипулін.
- В Америці деякий час назад з'явилися тести з мікрочіпами, що визначають рівень глюкози в крові або ВІЛ. Наші розробники прагнуть зробити щось подібне?
- Ви маєте на увазі тести Point-of-care? Вони дійсно є, але це поодинокі випадки. Є експрес-тести на вагітність з мікрочіпами, тести з двома основними маркерами інфаркту. У нас такі теж вже продаються, але вони недостатньо точні, все одно доводиться йти в лабораторію і здавати аналізи.
В Україні роблять тести з мікрочіпами, але для лабораторій, не для споживачів. Інститут молекулярної біології розробляє геномні - вони дозволяють виявити ДНК і РНК самого організму, а ЦНДІ епідеміології робить білкові. Я думаю, з часом геномні сенсори будуть витіснені секвенуванням.
- Що дає цей метод?
- Секвенирование дозволяє виявити нуклеотидную послідовність навіть у тому випадку, якщо ми не знаємо, що саме перед нами. Тобто воно здатне повністю визначити непізнаний об'єкт. Мікрочіп може розпізнати тільки задані молекули, а секвенатор - прилад універсальний, розрізняє все, що не відомо.
- Є ймовірність, що такі прилади будуть виробляти і в Україні?
- У нас розробкою секвенаторов поки не займаються, але вони є в наших лабораторіях. В цьому році провідними зарубіжними представниками було випущено одразу три машини, вони настільні, невеликі, стоять в районі 3 млн рублів, а це сьогодні може собі дозволити будь-яка баклабораторія. Наш інститут купив відразу два, перший запустили місяць тому.
- Щось вже вдалося дослідити на новому апараті?
- Так, уже отсеквеніровалі геном вакцини БЦЖ, яка використовується для імунізації проти туберкульозу. Поки ми її просто вивчаємо, геном бактерії - це дуже складно, в ньому десятки тисяч складових, в геномі закодовані всі властивості, як в книзі записана інформація у вигляді букв.
Ми хочемо зрозуміти, чим поганий наш штам, кінцева мета роботи - поліпшити нашу вакцину проти туберкульозу. В Україні найбільша епідемія туберкульозу в світі, але при цьому все щеплені. Ефективність вакцинації виявляється дуже малозначима.
Поки ми секвеніруем мікроорганізми, які були відкриті нашими батьками, а далі перейдемо до роботи з новим матеріалом.
- Коли секвенатори з'являться в лікарнях?
- Зараз я збираюся писати проект для уряду Москви, щоб у Другій інфекційної лікарні зробили центр з розшифрування випадків неясної етіології. Поки над хворим з неясним захворюванням лікарі, по суті, експериментують, пробують щось одне, то інше ліки, намагаються йому допомогти. У нас інший підхід: ми вважаємо, що за допомогою секвенування і білкових чіпів ми зможемо за один день встановити діагноз. З усіх інфекційних захворювань 80% викликають відомі мікроорганізми і 20% - не вивчення досі. Ми хочемо знати кожен з них, щоб, якщо людина несподівано захворів, ми протягом дня могли з'ясувати, від чого його лікувати.
No comments yet.